SVT

Chap. 1 :Devenir homme ou femme

2026-09-02T10:04:00Z

L'appareil reproducteur se met en place au cours de la vie embryonnaire et devient fonctionnel à la puberté

Le sexe biologique des êtres humains est bien déterminé : il est possible de caractériser à différentes échelles un individu de sexe masculin ou de sexe féminin.

Comment le sexe des individus est-il déterminé dès la fécondation ?
Quels sont les déclencheurs de la puberté ?

1.De la fécondation à la différenciation des appareils reproducteurs
Rappel : voc. de l'intro : app. reproducteur, embryon, puberté (manifestation physiologique), sexe biologique, fécondation
Activité 1 : TP n°1 les caractéristiques sexuelles

Bilan TP n°1 :
Dès la fécondation le sexe est déterminé par les chromosomes sexuels : XX chez la femme et XY chez l'homme (échelle génétique). Les testicules produisent des spermatozoïdes au niveau des tubes séminifères et les follicules ovariens localisés dans chaque ovaire contiennent chacun un ovocyte qui deviendra un ovule au moment de l'ovulation (échelle cellulaire). A l'échelle de l'individu, l'homme se caractérise sexuellement par un pénis, des testicules, de la barbe, une musculature développé, chez la femme, un vagin, un utérus, des seins, un développement des hanches.

Activité 2 : Les hormones sexuelles et la puberté
RAPPEL hormones avec exemples, ovocyte, ovule.

Relier le rôle des hormones à la puberté(disponible)
A partir de la puberté, la production des hormones sexuelles, oestrogène/progesterone chez la femme et testostérone chez l'homme entraîne l'apparition des caractères sexuels secondaire et le fonctionnement des appareils reproducteurs (spermatozoïdes, ovulation). Autrement dit, la présence d'hormones sexuelles dans le sang est à l'origine du déclenchement de la puberté. Sans ces hormones sexuelles, la puberté est absente et peut alors être déclenché et maintenu médicalement par des injections d'hormones sexuelles.

video d'une personne atteinte du syndrome de Kallman :https://www.youtube.com/watch?v=U074rCP0uyk&t=2s

Activité 3 : L'influence génétique sur la détermination du sexe - TP n°2 : du sexe génétique au sexe gonadique

BILAN TP
Lors du développement embryonnaire, la gonade se différencie en testicules ou en ovaires sous l'action de nombreux gènes sexuels. Le gène SRY présent sur le chromosome Y est à l'origine de la différenciation de la gonade en testicules. Sans ce gène les gonades se différencient naturellement en ovaires. Ce même gène fonctionnel transloqué sur un chromosome X s'exprimera. L'individu XX présentera alors des testicules

Chap.1 :L'évolution humaine

2026-09-02T07:40:00Z

L'évolution humaine est la partie de l'histoire du vivant qui débute par l'émergence du genre Homo et mène à l'espèce humaine actuelle (Homo sapiens).Au gré des nouvelles découvertes de nombreux fossiles, nos connaissances ont évolué et ont montré le caractère buissonnant et non linéaire de cette évolution humaine.

Comment les connaissances scientifiques actuelles notamment la phylogénie permettent-elles de retracer l'histoire de l'évolution humaine au sein du monde vivant ?

1.La place de l'espèce humaine parmi les primates]
Activité 1 : Arbre de parenté de quelques primates
Les primates sont un groupe de mammifères placentaires possédant entr'autre un pouce opposable, des ongles plats.

Remplir le document b à partir du doc.a et faire un arbre de parenté avec le tableau une fois rempli.

correction du tableau :
ongles : hommes, chimpanzé, gorille, macaque
griffes :taisier, maki, toupaïe
coccyx : homme, chimpanzé, gorille
queue : macaque, taisier, maki et toupaïe

Rappel : vidéo : commen lire un arbre de parenté.
https://www.youtube.com/watch?v=SfpbGt-ezCk
correction dispo

2.Les relations de parenté entre les humains et les grands singes]
Activité 2 : L'Homme parmi les grands singes
Grace aux documents c et d, pensez-vous que l'arbre de parenté réalisé est correct et complet, sinon apportez les modifications nécessaires.

correction dispo

On peut remarquer par la matrice des distances que l'homme et le chimpanzé ont le moins de différences génétiques ils sont donc plus proche que les autres grands singes, suivi du gorille et de l'orang-outan. On peut alors affiner notre arbre de départ :

BILAN
L'Homme présente des pouces opposables, des ongles et des orbites fermées (en avant de la face).Ces particularités sont des états dérivés de caractères partagés uniquement par les primates. Nous sommes donc des primates, au sein desquels, la présence d'un coccyx à la place d'une queue est caractéristique des grands singes, encore appelés hominoïdes. Nous sommes donc des grands singes, parmi les espèces actuelles, c'est avec le chimpanzé que nous partageons le plus de similitudes morpho-anatomiques et génétiques, c'est donc avec lui que nous partageons un ancêtre commun.

3.Homo sapiens et les espèces éteintes de la lignée humaine]
TP n°X : Prévoir un TP pour déterminer un classement et une détermination des espèces à partir des cranes et l'utilisation du logiciel CRANES de l'APBG ou logiciels HOMINES

vidéo sur l'apparition de l'espèce homo sapiens
https://www.youtube.com/watch?v=yd_bfJ9kpPA
La lignée humaine, ou groupe des homininés, comprend les humains et toutes les espèces fossiles plus proches parentes des humains que des chimpanzés. Les derniers ancêtres communs à la lignée humaine et celle des chimpanzés datent environ de 7 millions d'années.

Activité 3 : Définir le genre Homo

D'après le document pourquoi l'Australopithécus n'appartient pas au genre
Homo ?

L'australopithèque n'est pas du genre Homo car il n'a pas un volume cranien assez important 450cm3 contre plus de mille pour les genres Homos, par ailleurs il est prognathe, sa face est très avancé et non plate contrairement aux genres Homo.

Activité 4 : Homo Sapiens est-il un métissage d'espèces humaines ancestrales ?
Montrez que des hybridations ont pu avoir lieu entre Homo Sapiens et différents groupes du genre humain

correction dispo

Bilan TP

D'après le document a Homo sapiens est contemporain avec Néanderthalensis et Denisovia. Le document 2 montre que Denisovia était acclimaté aux hautes altitudes avec un gène particulier EPAS1 qu'on retrouve identique uniquement chez les tibétains eux-mêmes adaptés à l'altitude (voir les résultats d'anagene dans le doc.2). Les autres groupes d'Hommes actuels et Néanderthal n'ont pas le même gène. Les tibétains étant des Homos Sapiens, ils n'ont pu acquérir ce gène que par hybridation avec des Dénisoviens. La carte du doc. 1 nous confirme que les Dénisoviens ont cohabité avec des Homos sapiens dans la région du Tibet.

BILAN

Les tibétains ont acquis un gène provenant des Dénisoviens par reproduction entre ces deux espèces (métissage).On peut alors supposer que des hybridations ont pu avoir lieu également entre sapiens et néanderthaliens. L'évolution de l'espèce Homo sapiens n'est pas linéaire mais s'est enrichi de gènes utiles provenant d'autres espèces humaines. On parle de sélection par les gènes.

Depuis 2,5 Ma, des espèces appartenant aux genres Homo ont donc cohabité. Cette appartenance au genre Homo est attestée par des restes fossiles, une station bipède, le développement de la capacité crânienne, une régression de la face, une mandibule parabolique, un trou occipital centré, une activité culturelle...
Certains caractères sont transmis à la descendance sans mécanisme génétique :
– le microbiote qui est transmis en partie à la naissance et s'acquiert tout au long de la vie selon les habitudes alimentaires, etc.
– le langage articulé nécessitant des aptitudes anatomiques particulières (position du larynx) présent chez le genre Homo notamment, qui est transmis par un apprentissage indispensable.
– d'autres caractères sont transmis de manière non génétique : la culture, la maitrise d'outils.

VOCABULAIRE
arbre phylogenetique (nm) : schéma sous forme d'arbre qui représente les relations de parenté entre des groupes d'êtres vivants.
Primate (nm):Mammifère possèdant comme caractère dérivé : un pouce opposable et des ongles.
Grand singe(nm):primate pourvu d'un coccyx à la place d'une queue.
lignée humaine (nm):ensemble des espèces qui descendent de notre dernier ancêtre commun avec le chimpanzé.
Innovation évolutive :C"est un nouveau caractère (phénotype) acquis par mutation génétique permettant l'apparition d'espèces nouvelles à partir d'espèces existences.
Mandibule:machoire
prognathe une espèce possédant un ou deux mâchoires avancées par rapport à la verticale en allant du front au nez
Grand singe : primate pourvu d'un coccyx à la place d'une queue

Ressources vidéo :
Le métier d'anthropologue : https://www.inrap.fr/veronique-gallien-anthropologue-10725

La découverte de L'australopithèque Lucy par Yves Coppens en 1974 :
https://www.sciencesetavenir.fr/videos/yves-coppens-raconte-la-decouverte-de-lucy_uq03pk

Le séquençage du génome : https://www.youtube.com/watch?v=TCnG7R50IlU

Chap.1 : Les niveaux d'organisations de la matière (1ES)

2026-09-01T18:04:00Z

Depuis le big-bang jusqu'aux êtres vivants sur Terre, la matière n'a cessé d'évoluer depuis l'élément chimique le plus simple : l'hydrogène.
Existe-t-il différents niveaux d'organisations du vivant ?
Quelles propriétés de la matière permettent de dater des êtres vivants, des roches et même la Terre ?

1.La proportion des éléments chimiques entre la matière vivante et la matière inerte ?
activité 1-TP n°1 : comparaison de quelques molécules minérales et organiques :
A l'aide du logiciel rastop, visualiser les molécules suivantes :une paire de nucléotides, du cholesterol, une olivine (minéral constituant du basalte) et un feldspath (minéral constituant du granite).

Faire un tableau récapitulant les atomes constitutif des molécules citées plus haut.

Faites un bilan dans lequel apparaitra les éléments chimiques constitutif du monde minéral et du monde vivant.

BILAN(disponible)
Le monde minéral est constitué principalement des éléments : Si, C, O, Al. Le monde vivant est lui composé des éléments : C, H, O, N.

1.La radioactivité permet de dater les phénomènes anciens
Des isotopes de certains éléments chimiques sont instables et dits radioactifs, ils se désintègrent en éléments fils stables. L'élément instable de départ est qualifié de noyau atomique père. Cette désintégration est aléatoire et se produit à un moment imprévisible et indépendamment des autres noyaux d'un échantillon.

Activité 1 : Tache complexe : Datation au Carbone 14.
A partir des documents page 28 et 29, expliquer le principe de la datation au 14C, quelles sont ses limites ?
A sa mort un organisme n'absorbe plus de C14, le stock initial de C14 ne pourra alors que décroitre. On pourra alors estimer la date de mort de l'organisme en évaluant la quantité de C14 restante grâce à la courbe de décroissance du C14.D'après le doc.5, on peut voir que vers 50 000 ans il n'y a plus de C14, on ne peut alors pas dater un échantillon plus vieux que 50 000 ans, il s'agit de la limite de cette méthode. Il faudra alors utiliser un autre élément radioactif présent dans l'organisme pour évaluer l'âge d'un dinosaure par exemple (plusieurs millions d'années.)

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Répondre aux questions 2,4 page 29
Répondre aux questions 2,4,6 et 7 page 29

2). Le nombre de 14C décroit à partir de la mort de l'organisme.
4). On peut lire sur le graphique, un temps de demi-vie de 5500 ans
6).Le nombre initial de 14C est de 5.10(^10), 40% correspond à 5.10(^10) x 0,4 = 2.10.(^10) atomes de 14C. On reporte ce nombre sur le graphique, et on peut lire une temps de 7500 ans.
7).On reporte 0,7.10(^10) sur l'axe des ordonnées, on peut alors lire un temps de 17000 ans. On peut alors affirmer que la grotte était occupée il y a 17000ans.

demie-vie ou période :temps au bout duquel la moitié des noyaux radioactifs d'un échantillon s'est désintégré ! ; Elle est spécifique à chaque éléments et indépendante de l'environnement (Pression , Température).Exemple : Iode 123 : 13heures, Iode 131 : 8 jours, Carbone 14 : 5740 ans, Plutonimum : 30 ans, Uranium : 4,5 Milliard d'années.

https://www.youtube.com/watch?v=Aknzn4z7L_E

petite vidéo synthétique : https://www.youtube.com/watch?v=-_e6XVkMCcU

https://www.youtube.com/watch?v=uxW9D1d3uz8

EXERCICES

Exercice a la maison : ex.13 page 35
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1.1.La radioactivité au service de la santé
En plein développement la médecine nucléaire permet de diagnostiquer ou de traiter chaque année plus de 30 millions de personnes pour une soixantaine de maladies différentes.
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Correction disponible
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— >

2.Les minéraux, structures cristallines des roches et squelettes
Les minéraux constituent la plupart des roches, ils sont eux-mêmes constitués de cristaux aux propriétés physico-chimiques très précises permettant de caractériser la diversité des roches de notre environnement.

Activité 2 : document 3 page 43, le carbonate de calcium, une seule formule chimique plusieurs roches.
Expliquer comment une même espèce chimique le carbonate de calcium peut-elle donner deux roches aussi différentes ?

"A ne pas noter"La calcite est le polymorphe le plus courant du carbonate de calcium. Son nom provient du latin “Calx” qui signifie chaux. Elle se forme par précipitation du calcaire dans des grottes sus formes de concrétions.
L'aragonite est un polymorphe du carbonate de calcium découvert dans les Grottes de Molina (Espagne – Aragon) en 1775 par un naturaliste allemand du nom de Werner. Elle se forme dans des grottes à l'intérieur même de roches métamorphiques et sédimentaires.

C'est le type de structure cristalline dans laquelle se forme les cristaux qui est à l'origine des roches différentes, en effet l'aragonite a comme structure cristalline ou maille : la structure orthorhombique alors que la calcite cristallise dans une structure rhomboédrique. Si ces deux roches avaient la même structure cristalline alors elles seraient identiques. Analogie entre le diamant (maille cubique) et le graphite (mine de crayon, maille hexagonale)

Bilan
Une roche est formé de l'association d'un ou plusieurs minéraux, dont les propriétés dépendent de l'arrangement spatial (maille cristalline) des atomes les constituants. Un composé de même formule chimique peut cristalliser selon des conditions de température et de pression en différents polymorphes possédants des propriétés différentes.

Activité 3 : les conditions de formations des cristaux - TP n2 - Observations des minéraux dans deux roches volcanique et magmatique : le basalte et le gabbro
– 1. A partir du doc. du livre et de vos observations aux microscope faites deux dessins d'observations des deux lames microscopique et identifier les roches correspondantes,(gabbro et basalte) légendes : verre, minéraux

– 2. Identifier par un croquis (dessin simplifié) les roches basalte et gabbro présentes sur votre paillasse.

– 3. Faites un schéma fonctionnel sur les conditions de formations de ces deux types de roches

Bilan TP : La structure cristalline (cristaux occupant tout l'espace) des roches résulte d'un refroidissement lent (plusieurs centaines d'années) laissant le temps aux cristaux de se développer occupant ainsi tout l'espace, exemple :le granite ou le gabbro. En revanche un refroidissement rapide (quelques jours) conduit à une structure amorphe qualifié de verre comme le basalte avec de petits crsitaux. ( les cristaux restent petits car ils n'ont pas le temps de se développer étant figé par le refroidissement rapide

Vocabulaire :
Magmatisme : ensemble des phénomènes liés à la formation, au déplacement et au refroidissement des magmas.
Magma : matériau minéral à l'état liquide présent dans la lithosphère (en profondeur) et dont la température avoisine plusieurs centaines de degrés.

vidéo sur les minéraux : https://www.youtube.com/watch?v=v8WCT2V3NQ4
: de 6min40 à 11 min 50

BILAN
Les noyaux de certains atomes radioactifs sont instables et se désintègrent naturellement de façon aléatoire et indépendante. Quand le nombre de noyaux est important, la désintégration radioactive décroit au cours du temps, elle est divisée en deux au bout d'une durée appelée "demi-vie".
Une roche est formée par l'association d'un ou plusieurs minéraux, dont les propriétés dépendent de l'arrangement spatial des atomes les constituant. Un composé de même formule chimique peut cristalliser selon les conditions de pression et température en différents polymorphes possédant des propriétés macroscopiques différentes. La structure cristalline des roches résulte d'un refroidissement lent alors que la structure amorphe (verre) résulte d'un refroidissement rapide.
La bio-minéralisation est le processus par lequel les organismes vivants produisent des minéraux, souvent afin de durcir ou raidir leurs tissus pour former des tissus minéralisés.

3.La cellule, une structure complexe
Rappel sur la cellule :
Dessiner une cellule et légender votre dessin.

La cellule est l'unité structurale de tous les ........................ Certains sont constitués d'une seule cellule on parle d'êtres ................ D'autres sont constitués de plusieurs cellules, on parle d'êtres ............ .Les bactéries sont des cellules dépourvus de noyau on parle de cellule ................. Les cellules eucaryotes possèdent un noyau.

Activité 4 : La construction de la théorie cellulaire
Construisez une frise (à partir du livre p56-57 Ed.Hatier) dans laquelle vous inscrirez les avancées de chaque savant afin de retracer les grandes étapes de la théorie cellulaire.

La première observation de cellules est attribuée à l'anglais Robert Hooke qui plaça une coupe de liège sous un microscope fabriqué de ses propres mains et y observa de petites chambres.
La théorie cellulaire a émergé par la collaboration de plusieurs scientifiques :

- Tous les êtres vivants sont constitués d'une ou plusieurs cellules
- La cellule est la plus petite structure du vivant
- Toute cellule provient d'une autre cellule.

Activité 5 : Des microscopes de plus en plus performants
Le développement de microscopes de plus en plus performants à permis d'explorer en détails la cellule et son fonctionnement.

– > Donnez les types de microscopes et les avantages de chacun (p57-58) :
+ optique : peu couteux, facile d'utilisation, observation simple et rapide.(resolution:1um)
+ MET : meilleur grossissement 5 millions de fois ; observations des ultrastructures (organites)(resolution:1nm)
+ MEB : meilleur résolution jusqu'à 0,2 nm, rendu en 3D, observations fines des surfaces

Activité 7 : TP n°3 : Observation de feuilles d'élodées et/ou oignons au microscope

Prélevez deux feuilles d'élodée face supérieure et inférieure sur la même lame, versez-y une goutte d'eau iodée, recouvrir d'une lamelle.

1.a) Faites un dessin d'observation au grossissement adapté avec les légendes : membrane plasmique, paroi végétale (si visible) et chloroplaste
b) Faites un dessin d'observation d'un épiderme d'oignon, versez-y une goute d'eau iodée, recouvrir d'une lamelle. légendes : membrane, cytoplasme, chloroplaste et amidon*.

*l'amidon est visible bleu noir en présence d'eau iodée.

2.Calcul d'échelle : recopier la consigne 3 page 59

Correction :

calcul d'échelle :

Pour connaitre la taille réelle de la cellule d'élodée sur l'image, on réalise un produit en croix en se servant de l'échelle sur l'image (8 um)
dans le cas de l'image ci-dessous (mesure faite sur le tableau de la classe ) :

	échelle	cellule
taille sur l'image	7cm	46cm
taille réelle	8um	x

x = (46 x 8 )/ 7, alors x= = 52,6 um
La cellule d'élodée a une taille réelle de 53 um.
Le principe est le même pour les autres images.

Calcul du grossissement :
Le grossissement G correspond au facteur multiplicatif qui permet de passer de 53 um à 46 cm donc 53 um x G = 46 cm (attention à mettre dans les mêmes unités ) soit G = 460 000 / 53 = 8680 fois.
Rq : on a convertit 46cm en um d'où 460 000 um
Le grossissement est de 8680 fois.

Activité 8 : Parcours 1 :Structure de la membrane plasmique - Tache complexe
La membrane plasmique est la frontière ou séparation entre le milieu extracellulaire et l'intérieur de la cellule.
Comment est structurée la membrane plasmique des cellules ?

'A partir des documents page 60-61 (Ed. Hatier), et des questions de la page 61, réalisez un schéma de l'organisation de la membrane plasmique. Votre schéma devra comporter les glucides, lipides et protéines présent dans une membrane et l'agencement de ces derniers ainsi que les légendes : zones lipophiles et hydrophiles.

Activité 8bis : Parcours 2 :TP n°4 :Structure de la membrane plasmique avec le logiciel Rastop

Bilan TP :

– Par la théorie cellulaire on sait que la cellule est la plus petite entité vivante, que tous êtres vivant est constitué de cellules, et que toute cellule provient d'une autre cellule.
La membrane plasmique est constitué d'une double couche lipidique (phospholipide) orientant leur coté hydrophile à l'extérieur et l'intérieur de la cellule et leur coté lipophile (hydrophobe) à l'intérieur de la membrane. Des glucides (glycolipides) se trouvent du coté externe de la membrane alors que des protéines traversent de part et d'autres cette membrane (protéines transmembranaires) afin d 'assurer des rôles de transport (protéine canal) indispensable au bon fonctionnement de la cellule comme le glucose pour l'apport énergétique. Malheureusement cette porosité de la membrane permet aussi le passage d'élément nocif pour la cellule comme l'alcool, les drogues, les virus ... .

Exercice
Exercice 4 page 64
Si la molécule A peut traverser la membrane qui est fait de lipide c'est que la molécule A est lipophile. La molécule B qui elle passe à travers une protéine transmembranaire est alors hydrophile.

Exercice 10 page 67
1Une protéine peut s'insérer à travers une membrane plasmique si elle possède une partie lipophile
2.Le profil d'hydropathie du doc.1 correspond à une protéine qui a des partie hydrophobe (partie au-dessus de 0 couleur : rose) et des parties plus hydrophile (partie bleu).Il s'agit alors de la protéine A qui traverse la membrane.

Chap.1 : Reproduction conforme de la cellule méiose et réplication de l'ADN

2026-09-01T16:14:00Z

La division cellulaire ou mitose permet d'obtenir deux cellules filles identiques à la cellule mère, on parle de reproduction conforme.

Quels mécanismes permettent à une cellule de se diviser en deux cellules identiques ?

1. Rappel sous forme de Quizz

	VRAI	FAUX
Une molécule d'ADN est constitué de deux brins de même séquence nucléotidique.		X
La quantité d'ADN dans la cellule double juste avant la division cellulaire	X
La division cellulaire aboutit à la formation de deux cellules possédant la même information génétique.	X
Dans les cellules eucaryotes, le matériel génétique est stocké dans le cytoplasme		X
Dans une cellule eucaryote, chaque chromosome ne possède qu'un seul gène.		X
Au sein d'une population, les individus n'ont pas toujours les mêmes allèles d'un gène.	X

2. L'ADN et la division cellulaire

Entre deux divisions cellulaires, la cellule est dite en interphase, c'est la période la plus longue du cycle cellulaire.

Activité 1 : analyse de l'interphase

L'interphase se subdivise en trois étapes : G1, S et G2

– Après étude du document ci-dessous, réalisez un graphique représentant la quantité d'ADN en fonction du temps au cours d'un cycle cellulaire. Dans quelle phase augmente la quantité d'ADN Concluez.

Correction dispo

D'après le graphique la quantité d'ADN augmente uniquement lors de la phase S jusqu'à doubler en quantité.

Au cours des phases G1 et G2, la quantité d'ADN ne varie pas. A quoi peuvent bien correspondre ces deux phases ?

– Analysez le document 3 page 15, et répondez à l'interrogation précédente.

Le document a) montre que la masse et le volume moyen des cellules augmentent lors de l'interphase. D'après le document b), cette augmentation est liée à l'augmentation de la quantité de lipides et protéines dans la cellule lors de la phase G1. La phase G2 correspond à une croissance de la cellule et une division des organites cellulaires comme les mitochondries et les chloroplastes.

BILAN

Au cours de l'interphase, avant la division cellulaire la quantité d'ADN est doublée, lors de la phase S.Les phases G1 et G2 correspondent respectivement à l'augmentation de la quantité de macromolécules (lipides et protéines) et la phase de division des organites.

Les chromosomes sont constitués d'ADN, pourquoi les distinguent-on uniquement lors de la mitose ?

Activité 2 : TP n°1 les chromosomes et la mitose

En passant de l'interphase à la mitose, chaque filament d'ADN se sur-enroule sur lui-même : cet état très condensé forme un chromosome bien individualisé.

BILAN TP

Au cours de la division cellulaire ou mitose :
– l'ADN se condense et les chromosomes s'individualisent, ces derniers deviennent visibles au microscope optique. (Prophase)
Les chromosomes se placent ensuite vers l'équateur de la cellule.(Métaphase)
Puis, chaque chromosome se coupe longitudinalement de telle sorte que les deux chromatides de chaque chromosome migrent chacune vers un pôle de la cellule. (Anaphase)
les deux cellules filles apparaissent.(Télophase)

La mitose permet la conservation des caractéristiques du caryotype (nombre et morphologie des chromosomes) de la cellule mère. Les chromosomes sont des structures constantes des cellules eucaryotes pouvant être dans des états de condensations différents au cours du cycle cellulaire.

Activité 3 : les chromosomes et la méiose
La méiose comporte deux divisons cellulaires successives. Elle permet de produire des cellules haploïdes (n) à partir d'une cellule diploïde (2n).

– Quelle remarque faites-vous au vue du caryotype de ces cellules reproductrices ?

Elles ne possèdent que 23 chromosomes au lieu de 46.

Le document ci-dessous montre la formation des cellules reproductrices :

Expliquez à travers le document la formation des cellules reproductrices.

Une première division cellulaire sépare les chromosomes homologues. Une seconde division sépare chaque bras d'un chromosome double.

A partir du document 5 ci-dessus, faites un graphique comme celui de la mitose sur l'évolution de la quantité d'ADN en fonction du temps.

réponse dispo

BILAN

La méiose est constitué de deux divisions cellulaires successives. La première division permet la séparation des chromosomes homologues, et la formation de deux cellules filles haploïdes, à n chromosome double. La seconde division se déroule immédiatement à la suite de la première sans interphase. Elle permet la séparation des chromatides de chaque chromosome double.
Chaque cellule reproductrice reçoit ainsi un seul chromosome de chaque paire de façon aléatoire, les cellules reproductrices sont haploïdes.

TP 2 : Observation de coupe d'Anthères de Lys lors de la méiose :

3. Le mécanisme de déplacement des chromosomes
Au cours de la mitose et de la méiose, le comportement des chromosomes n'est pas le même.
On cherche à comprendre les mécanismes de séparation des chromosomes au cours des divisions cellulaire mitotique ou méïotique.

A travers le document ci-dessous décrivez les mécanismes à l'origine du déplacement des chromosomes.
Un fuseau de division composé de protéines se met en place sur chaque pole de la cellule sur lequel les chromosomes sont fixés assurant le déplacement. La différence de comportement des chromosomes entre la mitose et la méiose s'explique par d'autres protéines de fixations :la cohésine attachant les chromatides d'un chromosomes. Ainsi lors de la mitose, la cohésine attachant les chromatides se désintègrent lors de l'anaphase. Dans le cas de la méiose les chromosomes homologues sont attachés par un autre type de cohésine assurant leur séparation lors de la désintégration de cette protéine lors de l'anaphase de première division.Lors de la seconde division la cohésine des chromatides des chromosomes se désintègre à son tour pour permettre la séparation des bras des chromosomes.

4. Le mécanisme de réplication de l'ADN
On se demande par quel mécanisme l'ADN est dupliqué pour passer d'un chromosome simple à un chromosome double, la nouvelle chromatide formé étant un clone de la première.(Cf graphique phase S de l'activité 1)

site :
https://disciplines.ac-toulouse.fr/svt/experience-de-meselsonet-sthal
https://svt.ac-versailles.fr/IMG/pdf/tp2_meselson_et_stahl_2017_replicadn.pdf

– Relevez sur votre cahier, les trois hypothèse possibles du document ci-dessous

Activité 4 : TP n°2 Expérience historique sur la réplication de l'ADN

– A partir de l'expérience de Meselson et Stahl (ci-dessus), réalisez pour chaque hypothèse un schéma de la réplication de l'ADN en distinguant les brins lourds et léger sur deux cycles cellulaires. Représentez à coté de vos schémas, un tube à essai avec la ou les densités correspondantes.
En déduire l'hypothèse valide.

—> Faire la première hypothèse avec les élèves.}

Expérience de Taylor

Les résultats après un cycle cellulaire (voir les densités) permettent d'exclure les hypothèses sur le modèle conservatif. Le second cycle cellulaire avec la présence d'ADN léger valide la seconde hypothèse sur le modèle semi-conservatif

BILAN TP n°2

Lors de la réplication de l'ADN les deux brins de la double hélice sont séparés. Chaque brin sert de modèle pour la synthèse d'un nouveau brin d'ADN. L'enzyme responsable de la copie associe en face de chaque nucléotide du brin parental le nucléotide complémentaire (propriété de complémentarité des bases vu en seconde). Une molécule mère d'ADN est ainsi recopiée en deux molécules filles identiques à la molécule mère, ce qui donne alors un chromosome double prêt pour la division

Le document 3 page 19 montre comment une enzyme permet de répliquer l'ADN en ouvrant la double hélice validant le modèle semi-conservatif. Le nouveau brin est formé grâce à la complémentarité des nucléotides (A avec T et G avec C).

SCHEMA BILAN

4.Application de la réplication semi-conservative de l'ADN : LA PCR

Historique

Cette méthode de Biologie Moléculaire a été mise au point en 1985 par Kary Mullis, qui obtint pour ces travaux le prix Nobel de Chimie en 1993. Ce procédé révolutionnaire couplé à l'utilisation d'une ADN polymerase thermorésistante permet d'obtenir, sans clonage, une amplification considérable d'un fragment donné d'ADN.

animation : https://rnbio.upmc.fr/sites/default/files/animations/bio_mol/pcr/pcr.html

VOCABULAIRE

cycle cellulaire (nm) : ensemble des modifications subies par une cellule depuis sa formation jusqu'à sa division en deux cellules filles.

interphase (nf) : phase du cycle cellulaire séparant deux mitose (division cellulaire).

mitose (nf) : Division cellulaire assurant à chacune des deux cellules-filles une information génétique en principe identique à la cellule mère. cliquer ici pour une animation

méiose (nf) :
Double division de la cellule aboutissant à la réduction de moitié du nombre des chromosomes, et qui se produit au moment de la formation des cellules reproductrices, ou gamètes.

chromatide (nf) filament constitué d'une molécule d'ADN constitutant un chromosome simple ou un chromosome double lorsque deux chromatides soeurs identiques sont lié.
haploïde (adj) :Une cellule haploïde est une cellule qui ne comporte qu'un seul exemplaire de chaque chromosome (n chromosomes), inversement à une cellule diploïde, qui contient deux chromosomes homologues pour chaque type de chromosome (2n chromosomes)

Complémentarité des bases (nf) : L'Adénine d'une molécule d'ADN est toujours associé à la Thymine de l'autre brin.La Cytosine est toujours associé à la Guanine de l'autre brin.

modèle semi-conservatif (nm) : modèle expliquant le mode de réplication de l'ADN. Un des deux brin servant de modèle pour la synthèse de l'autre brin.

Ce que je dois savoir faire

– savoir reconnaître les différents état de condensation de l'ADN
– caractériser les différentes phases du cycle cellulaire
– Connaitre les étapes de la mitose et de la méiose
– comprendre les expériences historiques qui ont confirmé le mécanisme de réplication semi-conservative de l'ADN

Alignement de séquences avec discontinuité (notion de programmation dynamique)

2026-05-16T21:23:45Z

Objectif : Comprendre comment on compare l'ADN pour retracer l'évolution, sans plonger dans des calculs mathématiques lourds.
logiciels : Thonny (Python) préinstallé par les ELIB sur nos postes.

Le grand défi avec les élèves est de leur faire comprendre qu'aligner deux séquences d'ADN ne consiste pas juste à compter les lettres identiques et les mutations de substitutions. Il faut intégrer les mutations. Le programme fourni utilise la méthode du Dot Plot (Matrice de points).
Il matérialise visuellement les accidents génétiques (insertions/délétions) en introduisait la notion de structure de données bidimensionnelles (tableau ou matrice f(i, j) à deux entrées :horizontale = séquence 1 et verticale = sequence2) pour résoudre un problème biologique.

1. Notion de "Gap" : Évolution du Vivant et Phylogénie
En classe, il faut insister sur le fait que l'ADN subit deux grands types de mutations :

– Les substitutions : Une lettre change (ex : A devient G).

– Les Indels (Insertions / Délétions) : Des morceaux d'ADN sont gagnés ou perdus au fil des générations => C'est là qu'apparaît la notion de Gap (représenté par un tiret -).
Si la Séquence 1 a un Gap (-) par rapport à la Séquence 2, cela signifie soit que la lignée 1 a perdu un nucléotide au cours de l'évolution (délétion), soit que la lignée 2 en a gagné un (insertion).

Lien avec la phylogénie : Plus deux espèces partagent des gaps et des blocs de séquences identiques placés aux mêmes endroits, plus leur ancêtre commun est récent. L'alignement est la première étape obligatoire pour construire un arbre phylogénétique.

Principe :
Pour repérer les discontinuités (gaps), suivez la diagonale formée par les points bleus de haut-gauche à bas-droite.

Règles de déplacement :
• La diagonale avance normalement : Les séquences s'alignent parfaitement.
• Saut HORIZONTAL (vers la droite) : Il manque une ou plusieurs lettres dans la Séquence 2 (Verticale). On ajoute un '-' dans la Séquence 2 pour compenser.
• Saut VERTICAL (vers le bas) : Il manque une ou plusieurs lettres dans la Séquence 1 (Horizontale). On ajoute un '-' dans la Séquence 1 pour compenser.

2. La complexité de la tache sur des gènes composés de plusieurs centaines de nucléotides - lien vers la programmation dynamique
À l'aide des exemples fournis dans l'application (notamment l'exemple C : AGCATA vs AGCTATA), on montre aux élèves que l'œil humain a ses limites. Face à une rupture de diagonale (cheminement dans la matrice en diagonale), plusieurs chemins (plusieurs alignements avec des gaps placés différemment) sont parfois également valables.D'où la question : Si nos séquences faisaient 10 000 nucléotides de long avec des centaines de gaps, comment ferait-on ? L'ordinateur peut-il tester toutes les combinaisons au hasard ?Réponse : Non, le nombre de combinaisons possibles est astronomique (2^(2n) environ). C'est là qu'intervient la Programmation Dynamique et l'algorithme de Needleman-Wunsch utilisé par BLAST ou Anagène mais dont le principe nécessite des connaissances universitaires (hors périmètre) d'où l'intérêt de ce programme qui de façon simple et de portée pour nos lycéens en spécialité aborde la notion d'alignement avec discontinuité par une matrice de points.

Activité chap. 6

2026-05-11T06:26:00Z

- Activité 2
- #1
– A partir des documents page 102-103 du livre, faites un tableau regroupant les trois types de modalités de communications intraspécifiques et les trois grandes fonctions biologiques auxquelles elles participent

modalités de communications	fonctions biologiques associées
le son (hurlement du loup, chant des grillons)	chasse / parade nuptiale
les phéromones du lapin et de la fourmi	(nourriture pour les lapereaux / signaux d'alertes pour le fourmis
la vision (queue colorée du quetzal, bioluminescence des lucioles)	parade nuptiales

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- #2
La femelle choisit le mâle le plus fort ou le plus beau (combats, couleurs, parade ...), signe de vitalité et bonne santé. Ainsi ce mâle sera toujours choisi pour la reproduction. Par conséquent ce sont toujours ces même caractères génétiques du mâle qui seront transmis aux générations futures, montrant le rôle joué par cette sélection sexuelle dans l'évolutions des espèces.
Par exemple, le cerf mâle ayant les bois les plus longs gagnera souvent le combat entre mâles, et sera donc systématiquement choisi par la ou les femelles.Le paradoxe est que ce mâle ayant les bois les plus longs représente un désavantage pour la fuite face à un prédateur (poids, encombrement) et aura donc tendance a être éliminé avant les autres., tout comme la queue échancré la plus grande (désavantage) pour l'hirondelle mâle reproductrice.

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- Activité 3
#3
Etudiez le document ci-dessous sur le géospize ou plus communément le pinson de Galapagos.

Les oiseaux à gros bec sont capables de casser les graines durcies par la sécheresse. Les oiseaux à petit bec étant incapables de casser ces graines, leur population a finie par disparaître. Le nouveau caractère gros bec est apparu par mutation et a donc donné un avantage à ces oiseaux qui ont donc pu s'adapter à la sécheresse. C'est la sélection naturelle, théorie développée par Darwin. La sécheresse (ou la sélection naturelle) a ainsi sélectionné les pinsons à gros bec.

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#4
Expliquez alors le caractère "long cou" d'une girafe

Le caractère "long cou" est dû à une mutation qui a procuré un avantage aux girafes. En effet, celles-ci ont pu manger les feuilles des arbres contrairement aux autres êtres vivants, les girafes ont donc pu plus facilement se reproduire. Il s'agit là d'un autre exemple de sélection naturelle.

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#5
A partir du logiciel de modélisation suivant, vous allez déterminerez le ou les facteurs intervenant dans la dérive génétique expliquant cette possible diminution allélique.Vous résumerez alors en une ou deux phrases la dérive génétique et ses conséquences.

La simulation avec un effectif faible n=100, fait varier la fréquence de l'allèle A avec une grande amplitude en haut comme en bas, ainsi on peut voir la fréquence de l'allèle A à 0 sur certaine simulation, signifiant la disparition de cette allèle, de la même manière, sa fréquence peut être a 100% signifiant la disparition de l'allèle B.
En revanche, un effectif plus important n=1000, montre une certaine constance dans la variation de la fréquence allélique, en effet les différentes simulations oscillent autour des 50% sans jamais atteindre 0 ou 100%, ainsi il n'y a pas de disparition d'allèle dans une population importante.

Si on fait varier cette fois-ci le nombre de générations on peut remarquer que la variation de fréquence de l'allèle est plus marqué quand le nombre de générations est importantes.Autrement dit, plus il y a de générations plus les écarts de variations sont importants, et plus il y a de chance de disparition d'allèles.

En résumé, la dérive génétique fait disparaître des allèles et appauvrit alors la biodiversité génétique des populations quand l'effectif de la population est faible : quelques dizaines d'individus.

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Chap.9 : L'immunité

2026-05-06T13:50:38Z

Chaque jour, notre organisme est exposé à une multitude de micro-organismes (bactéries, virus, champignons) présents dans notre environnement. Pourtant, nous ne tombons pas malades en permanence.

Dès qu'un agent pathogène franchit les premières barrières de l'organisme, une réponse rapide se met en place : l'immunité innée. Cette première ligne de défense agit immédiatement pour limiter la propagation de l'infection.

Comment l'organisme détecte-t-il et combat-il rapidement un agent pathogène dès son entrée dans le corps ?

1. Une première ligne de défense immédiate : l'immunité innée
Activité 1 : Les mécanismes immunitaires au cours de l'évolution du vivant
Montrer que les mécanismes de la défense immunitaire sont innés et reposent sur des mécanismes apparus chez un ancêtre commun à de nombreux êtres vivants

L'immunité innée existe chez tous les êtres vivants pluricellulaires avec des mécanismes communs à de très nombreux groupes parfois très éloignés. On peut alors supposer que les mécanismes et les molécules impliquées sont apparues très tôt dans l'histoire de la vie et qu'ils se sont conservés au cours de l'évolution.

Vocabulaire :
phagocytose :La phagocytose est le mécanisme par lequel les phagocytes, des cellules qui font partie des globules blancs, ingèrent les microbes et les digèrent. C'est un mécanisme d'élimination des micro-organismes.
inflammation : C'est la première réponse des tissus face à une agression telle qu'une infection, une brûlure, une plaie, etc. Ce processus est bénéfique pour l'organisme, il permet la mise en place d'une réponse immunitaire rapide pour éliminer l'agent en cause et réparer les tissus lésés.
plasma : partie liquide du sang contenant notamment les globules rouges, les leucocytes et les plaquettes.
médiateur chimique de l'inflammation :Substance synthétisée et libérée par une cellule du système immunitaire, intervenant dans le processus de l'inflammation
immunité innée : C'est une réponse immédiate qui survient chez tout individu en et qui est standardisé contrairement à l'immunité adaptative qui est spécifique.

Activité 2 : la réaction inflammatoire - tache complexe
Réaliser un schéma fonctionnel illustrant l'enchainement des différents processus conduisant à l'élimination d'un agent pathogène.

BILAN :
Pour maintenir l'intégrité de leur organisme, tous les êtres vivants possèdent des systèmes de défense dont la similitude de certains aspects est en faveur d'une origine commune L'immunité innée est déterminée génétiquement et constitue dès la naissance une des premières lignes de défense d'un organisme face à un agent pathogène, un tissu lésé ou une cellule cancéreuse. Elle se caractérise par la réaction inflammatoire, qui, en phase aiguë, présente des symptômes stéréotypés. Lors d'une infection, les cellules immunitaires "sentinelles" détectent grâce à leurs récepteurs de surface, des molécules communes à de très nombreux agents pathogènes. Cette interaction déclenche la production de médiateurs chimiques responsables de l'afflux de nombreux leucocytes qui éliminent les pathogènes principalement par phagocytose. Des signaux régulateurs sont émis en fin d'inflammation pour éviter la détérioration des tissus. La réaction inflammatoire aiguë initie la réponse immunitaire adaptative par l'intermédiaire des cellules présentatrices d'antigènes. Elle peut être contrôlée par des médicaments anti-inflammatoires, utiles notamment pour réduire la douleur.

2. L'immunité adaptative

Lors d'une infection virale, les différents acteurs de l'immunité s'activent tout d'abord ceux de l'immunité innée, suivi si il y a lieu de l'immunité adaptative selon le schéma ci-dessous :

vocabulaire :
Chercher la définition des mots suivants :
Lymphocyte : cellule du système immunitaire qui aide l'organisme à se défendre contre les microbes et les virus.
Plasmocyte:cellules issues des lymphocytes B, spécialisées dans la fabrication et la libération d'anticorps en grande quantité lors d'une réponse immunitaire.
Lymphocyte B : cellule du système immunitaire capable de reconnaître un antigène et de se transformer en plasmocyte pour fabriquer des anticorps. Certains deviennent aussi des lymphocytes mémoires.
Lymphocyte T : cellule du système immunitaire intervenant dans la défense de l'organisme. Certains lymphocytes T détruisent les cellules infectées, tandis que d'autres coordonnent la réponse immunitaire
Anticorps : protéine en forme de Y fabriquée par certains lymphocytes pour reconnaître et neutraliser un microbe ou un virus.
Charge virale : quantité de virus présente dans l'organisme, souvent mesurée dans le sang.
Séropositif / séronégatif : personne chez qui un test sanguin révèle la présence / l'absence d'anticorps contre un virus ou une maladie.

Activité 3 : TP n°16 : Le mode d'actions des anticorps par immuno-diffusion sur gel agar-agar - test d'Ouchterlony

Bilan TP
Ce TP montre que les anticorps sont spécifiques d'un antigène donné. Lorsqu'ils rencontrent l'antigène d'intolérance à une protéine du lait de vache : la β-lactoglobuline, ils forment un complexe visible sous forme d'un arc de précipitation. L'absence de réaction avec le lait de soja ou le lait hypoallergénique indique que celui-ci ne contient pas cet antigène. Cela explique pourquoi certaines personnes intolérantes ou allergiques au lait de vache peuvent consommer du lait de soja sans réaction immunitaire donc sans allergie.
La structure pat RASTOP d'une molécule d'anticorps présente deux régions l'une hyperconservée sans changement et deux autres aux extrémités du Y très variable responsable de la spécificité des anticorps aux antigènes.

Le génome contient environ 20 à 25000 gènes or les antigènes possibles se comptent par millions.
Comment l'organisme s'y prend-t-il pour être capable de faire face à tant de possibilités d'antigènes sachant qu'un anticorps est spécifique à un seul antigène ?

Activité 4 : répertoire immunitaire et maladies auto-immunes
Répondre à la question ci-dessus en analysant le document suivant et voir quel danger potentiel l'organisme doit écarter

Des mécanismes aléatoires engendrent une diversités des récepteurs des anticorps par d'une part des recombinaison de segments de gènes exprimant les parties constantes et variables des chaines lourdes et légères des anticorps et d'autres part l'assemblage aléatoires de ces différents chaines.
La possibilité de recombinaison aléatoire aboutissant à des anticorps attaquant nos propres récepteur membranaire de nos cellule (appelé communément "le soi") est à l'origine de maladies auto-immunes comme la narcolepsie. Dans la majorité des cas l'organisme est capable d'éliminer efficacement ces anticorps dangereux en effectuant un tri entre les anticorps nocifs et inoffensifs pour notre organisme.

Activité 5 : TP n°17 - dépistage de maladies infectieuse - le test ELISA

Le test ELISA permet de détecter la présence d'anticorps spécifiques contre le virus de la rougeole dans le sérum. Plus la coloration bleue est intense, plus la quantité d'anticorps est importante.
Chez Yasmine, la teinte bleue observée est plus claire que celle du témoin positif : cela montre qu'elle possède peu d'anticorps contre la rougeole. Sa protection immunitaire est donc insuffisante.
La vaccination repose sur l'injection d'un agent pathogène atténué ou inoffensif qui déclenche une réponse immunitaire sans provoquer la maladie. L'organisme fabrique alors des anticorps spécifiques et des lymphocytes mémoires.
Cette mémoire immunitaire permet à l'organisme de réagir plus rapidement et plus efficacement lors d'un nouveau contact avec le virus. Cependant, la quantité d'anticorps peut diminuer au cours du temps ; des rappels vaccinaux sont donc parfois nécessaires pour maintenir une protection suffisante.
On peut donc conclure que Yasmine devrait recevoir un rappel de vaccin contre la rougeole afin de renforcer sa mémoire immunitaire et d'être correctement protégée contre cette maladie très contagieuse.

2. Stratégie immunitaire pour lutter contre le cancer
Les connaissances du système immunitaire ont permis de développer de nouveaux traitements contre les cancers

Activité 6 : Traiter un cancer du sein avec des anticorps monoclonaux
Donner le principe du traitement
vocabulaire :
anticorps monoclonaux :anticorps fabriqués en laboratoire à partir d'un même et seul lymphocyte B, tous identiques et capables de reconnaître une seule cible précise (un antigène). Ils sont utilisés en médecine pour diagnostiquer ou traiter certaines maladies.

Le gène HER2 (Human Epidermal growth factor Receptor 2) contrôle la fabrication d'une protéine présente à la surface de certaines cellules.
Dans certains cancers du sein, le gène HER2 est présent en trop grande quantité : on parle de cancer du sein HER2 positif. Les cellules produisent alors beaucoup trop de protéines HER2, ce qui stimule fortement leur multiplication.

Après fabrication en laboratoire, les Ac monoclonaux vont être capable de se fixer sur les antigènes (protéine HER-2) présents à la surface des membranes plasmique et éviter ainsi la multiplication cellulaire des cellules tumorales en bloquant le signal cellulaire de prolifération comme on peut le voir sur le graphique ou le volume tumorale ne croit pas avec le traitement.

Restitution parc marin

2026-05-05T12:35:45Z

Les photos sont disponibles en bas du document, vous pouvez les télécharger
Support possible :

+ Oral classique (1min30 par personne) Deux diapositives par groupe, ==> deux élèves par diapo.
+ Bande dessinée (1 planche- format A3 canson) - 45 secondes par personnes.
+ vidéo théatrale : 30 secondes par personnes a l'oral
+ Poster - Affiche (1min15 / personne)

Des photos seront dispo sur le site.

Groupe 1:Sortie Criée Arcachon (BD)
elona
Léna
Anais
Manon

Groupe 2:Réserve ornitologique (oral classique)
elina
leelou
anissa
jennyfer

Groupe 3:Sortie 3 - Erosion marine
Mélyne
Loan
Lison
Héloise

Groupe 4:Sortie 3 - Erosion marine
Rosalie
Salomée
Clara
Aly

Groupe 5:Sortie 3 : protocole OSPAR (nettoyage des plages -plage de la lagune) video
Timéo
Maelize
Joakim
Emie

Groupe 6:Sortie Criée Arcachon
Benjamin
Ewan
Titouan
Mael

Groupe 7 : Sortie 2 : Réserve ornitologique
Eliott
TOm
Léo
Gabin

Groupe 8:Sortie 3 : protocole OSPAR (nettoyage des plages -plage de la lagune)
Pascal
Nattan

ORAL passage ES

2026-04-24T12:40:59Z

Oral passage 104

Oral passage 106

Oral passage 102

Simulation d'une banque de donnée (typeNCBI Genbank)

2026-04-14T08:24:21Z

Genbank est une base de donnée publique internationale américaine qui centralise d'énormes quantités de données de génomiques (ADN, ARN), protéomique et bien d'autres choses.
Les différents fichiers utilisé par Anagène proviennent de cette banque.
Elle constitue un outil central de la bioinformatique moderne et de la recherche en génétique.

Objectifs : Initier aux principes fondamentaux de la bioinformatique et des bases de données, tout en rendant accessible la logique de stockage et d'interrogation des données biologiques.

Pré-requis : notions python vues en SNT seconde, console pyhton Thonny ou autre installée.
Public visé : Classe de première Spécialité.
pré-requis enseignant : aucun

Dans les pratiques scientifiques actuelles, les séquences génétiques ne sont plus seulement observées en laboratoire : elles sont aussi stockées, partagées et analysées sous forme numérique. GenBank illustre ainsi la transition de la biologie vers une science des données, où l'exploitation informatique des séquences est devenue essentielle.

Son utilisation permet notamment la comparaison de séquences, l'identification de gènes, l'étude de la diversité du vivant et l'analyse des relations évolutives entre espèces.

Dans un cadre pédagogique, s'appuyer sur un simulateur inspiré de GenBank permet d'initier les élèves aux principes fondamentaux de la bioinformatique et des bases de données, tout en rendant accessible la logique de stockage et d'interrogation des données biologiques.

Principe :
Le simulateur est fait en python et utilise le module sqlite permettant d'interroger la base avec le langage SQL.
But : + simuler l'introduction de séquences de gène (sequence fictive courte ou réelle norme FASTA à partir de GenBank voir paragraphe suivant) dans une base de donnée.
+ Faire une interrogation de la base de donnée.
+ Etre capable de calculer la longueur d'une sequence (fontion sql)

Interfaces :

L'unique table a interroger s'appelle séquences_adn et comporte les colonnes suivantes : id, nom, organisme et sequence.
Exemple de requêtes SQL simples :
— >Tout afficher
SELECT * FROM sequences_adn ;
— >Chercher le gène EPAS1
SELECT * FROM sequences_adn WHERE nom LIKE '%EPAS1%' ;
— >Calculer la longueur d'un gène
select length(sequence) from sequences_adn where nom like '%EPAS1'
— >Chercher un motif (codon START)
select * from sequences_adn where sequence_adn like"%ATG%"

Récupérer la séquence d'un gène sur Genbank
Aller sur le site ncbi : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
Sélectionner en haut a gauche dans le formulaire la base nucléotide, dans le champ a coté tapez EPAS1 par exemple et cliquer sur "search".

Dans la nouvelle page sélectionner le fichier proposé en encadré correspondant à la lignée humaine :" EPAS1 endothelial PAS domain protein 1"
Cliquer sur la nouvelle page "Download datasets". Dans la boite de dialogue qui apparait cocher "gene sequence FASTA" et cliquer sur download". Un fichier EPAS1_datasets.zip est alors téléchargé dans l'onglet Téléchargements de votre ordinateur. Dézipper le et le fichier nommé :"gene.fna" se trouve dans le chemin suivant :"ncbi_datasets/data/
Pensez à renommer votre fichier au nom du gène ici EPAS1.fna ou EPAS.fasta

Ci-dessous, une vision du contenu du fichier.

Conclusion :
Ce simulateur permet de faire comprendre que :
une base de données biologique est simplement une organisation structurée de l'information génétique, interrogeable de manière logique (SQL), comme en bioinformatique réelle.